A ver... bajo mi punto de vista...

¿Los hijos que tiene son de esa relación? Sean o no, yo creo que... lo mejor es que ella decida lo que tiene que hacer sin que tu medies en ello. Ella tiene una relación de 3 años ya y 2 hijos como has dicho, si lleva 3 años y no le ha dejado (si está tan mal) por algo será. Que se meta un 3º en una relación y la rompa es duro, puedes confundir a la chica y que ella no sepa ni realmente lo que quiere y al final todo se joda, por todas las partes.

Yo creo que lo mejor que debes hacer es... esperar o hablarlo con ella claro (cuando lo creas oportuno). No vayas directamente con esa intención por que quizas haces daño a la pareja y si encima tienen 2 hijos....

Al igual otra persona te diria "haz lo que el corazon te dicte... que el amor no tiene barreras...blablabla", pero hay que pensar en estas cosas un poco con la cabeza, y pensar las consecuencias.